《神兵小将1 下部》延续上部剧情，南宫问天、南宫问雅兄妹继续踏上拯救玉龙国的冒险之旅。问天手持神兵天晶，与好友们一起对抗邪恶势力玄天邪帝。邪帝妄图统治玉龙国，派出手下的魔兵兽四处破坏。问天在旅途中不断结识新伙伴，如灵剑双子中的灵剑星姬和灵剑火姬，她们拥有强大的灵剑神兵。期间，问天等人还遇到了各种困难与挑战，像在阴森诡异的魔宫，他们遭遇重重机关和强大敌人。不过，问天凭借坚定的信念和天晶的力量一次次化险为夷。问雅则用她的善良和治愈能力帮助大家。最终，问天带领伙伴们与邪帝展开终极对决，成功击败邪帝，守护了玉龙国的和平。