《工作细胞》将人体比作一个庞大的社会，细胞们则是在其中各司其职的工作人员。故事围绕着开朗活泼的红细胞 AE3803 展开，她的工作是在身体内输送氧气和二氧化碳。在一次运送任务中，她迷路了，还遭遇了细菌的袭击，幸好得到了白细胞 U-1146 的救助。此后，红细胞在工作中状况不断，但始终努力完成任务。除了红细胞和白细胞，血小板们也十分可爱，它们会齐心协力修补破损的血管。此外，还有负责消灭病毒的杀手 T 细胞、调节免疫的辅助 T 细胞等。这部动画通过一个个有趣的故事，生动地展现了细胞们在人体内的工作过程，让观众在欢笑中了解人体的生理知识。