《我的奇怪朋友》围绕着高中生云奕和慕晓这对欢喜冤家展开。云奕因一场意外拥有了能听到他人心声的超能力，这能力给他带来了不少困扰。比如在课堂上，他会被同学们杂乱的心声干扰，无法集中精力学习。而慕晓性格大大咧咧，是学校里的“小辣椒”。一次偶然的机会，慕晓发现了云奕的秘密。此后，两人的生活发生了一系列有趣的故事。他们一起利用云奕的超能力帮助同学解决难题，也在这个过程中逐渐加深了对彼此的了解。在面对校园霸凌事件时，他们携手对抗，凭借超能力和智慧让霸凌者受到应有的惩罚。随着时间的推移，云奕和慕晓在相互扶持中，懵懂的感情也悄然萌芽。